Wanneer een lokaal bestuur in gebreke blijft bij de vaststelling van een milieudelict, kan de gouverneur bestuurlijke maatregelen (bevel tot staking, bevel tot regularisatie,…) opleggen. Dit gebeurt enkel op basis van een verzoek van een toezichthouder. Deze bevoegdheid van de gouverneur is complementair aan de bevoegdheden van de lokale overheden. Zij moeten in eerste instantie optreden, in het kader van het subsidiariteitsbeginsel. Pas wanneer de lokale overheden te kort schieten, komt de gouverneur in beeld.
